Мультфильм «Самурай Джек» переносит зрителя в страну восходящего солнца – Японию 16 века. Мирному населению угрожает большая опасность в лице опасного и жестокого демона Аку. Чтобы не дать его коварным планам сбыться, император издает указ о создании волшебного оружия в виде катаны, после чего процессом ее изготовления начинают заниматься придворные маги. Мощное оружие позволило одолеть Аку, и демон превратился в камень.

Прошло уже 8 лет с тех пор, как получилось одержать победу над злыми силами. Но все меняется после солнечного затмения, когда демону вновь удается обрести свою плоть и силу. За эти годы у императора подрос сын, который на протяжении всей своей жизни овладевал разными искусствами, начиная от езды верхом и заканчивая оружием, борьбой. Самурай держит путь в родные края, где мать передает ему катану. Теперь главному герою предстоит противостояние с Аку, обладающего способностью перевоплощения в разных существ, но не способного устоять перед силой тренированного самурая.

Просматривая аниме «Самурай Джек», вскоре становится понятно, что демон предчувствует свое поражение и создает портал, который телепортирует главного героя в далекое будущее. Теперь главная задача Джека заключается в возвращении в свое время. Ему предстоит столкнуться с множеством проблем и пройти массу испытаний для того, чтобы найти возможность исправить ситуацию.